Научный метод разрабатывали люди достаточно религиозные. Ньютон был богословом. Дарвин утверждал, что понял метод бога и т.д.
Наука - опыт человечества. Вера занимается тем, что на опыте не проверить в принципе. Между ними нет противоречия.
Конечно мифы конкретной религии могут науке противоречить. Но это уже не про Веру, а про Религию.
И все же связь между наукой и атеизмом существует. Статистическая. Чем более высокий уровень ученых мы будем рассматривать, тем большая доля из них окажется атеистами. Тем меньше будет там людей религиозных и тем более воцерковленных.
Что опять таки ничего не доказывает.