Какова была разница между завоеванием Южной и Северной Америки?

Тут раздел пролегает не столько по континентам, сколько по завоевателям. Территория Мексики формально относится к Северной Америке, но по факту у этой страны больше общего со странами Южной и Центральной. Да, Мексику обычно причисляют к "Центральной".

Ладно, попробуем по существу:

1. В Центральной и Южной Америке испанцам пришлось столкнуться со сложившимися государствами и цивилизациями. Их пришлось действительно завоёвывать. Англичане же (вначале были ещё и голландцы, шведы, немцы...) скорее планомерно выдавливали первобытные индейские племена, часто за счёт натравливания одних на других.
2. Португальцам с цивилизациями столкнуться не довелось, но и они действовали по-другому, нежели на севере.
3. После резни в ходе завоевания, испанцы и португальцы присылали своих колонистов, которые активно смешивались с местным населением, когда то принимало христианскую веру. Германские народы действовали совершенно по-иному. Ни жениться, ни тем более выйти замуж за индейца было недопустимо. Местное население на территориях нынешних США и Канады планомерно вытесняли, загоняли в резервации, и вообще выживали. Ацтеков сейчас больше миллиона; кечуа и аймара и сейчас составляют большинство населения бывшей империи инков. В Бразилии потихоньку формируется что-то вроде единого типа из смеси индейского, европейского и африканских элементов. В Северной Америке же и сейчас расовые барьеры играют важную разделяющую роль.

P.S: к слову сказать, русское покорение Сибири и Дальнего Востока прошло скорее ближе к тому, что практиковали англо-саксы. Русские живут в основном раздельно с местными аборигенами, метисов очень мало. Почему коренные народности Севера, Сибири и Дальнего Востока, в целом, не пришлось "завоёвывать" или переселять в резервации? Их изначально было довольно мало из-за тяжёлых климатических условий. (Если последить по широтам, то и США, и большая часть Канады находятся гораздо южнее Poсcии - южнее ключевой 60 широты). Русские селились отдельно - там где климат лучше, и хоть как-то подходит для европейского образа жизни. Алкоголь и эпидемии сделали ненужным вооружённые схватки.