Добрый день, Елана.
Для контроля могу подсказать -
https://hrundl.com - по опыту - очень удобная и недорогая программа.
Для мотивации - должны быть KPI
Подскажите, чем занимается сотрудник, попробуем вместе понять измеряемые показатели.
Главный мотиватор, как правило - деньги. KPI позволит больше зарабатывать (или терять, если он и в + и в - ) - как следствие мотивация.