Так что же всё-таки можно считать манипуляцией?

Сведений не так много в вопросе, чтобы понять:  имела ли место быть манипуляция.

Что понимается под манипуляцией? Скрытое управление другим человеком, использование его, не учитывая его чувств, эмоций, не давая право на свободу слова или голоса.

Зачастую, когда позиция собеседника слаба, т.е. находится в позиции  "ребенка".  Другой участник беседы давит, искажает факты, вызывая у визави дискомфорт. Если это тот случай, тогда речь идет о манипуляции.

 Если задней мысли, как Вы пишете, не было. В качестве аргумента в спорной теме приведен источник. Причём, источник, вызывающий доверие, научный, авторитетный. Собеседники используют корректные приемы спора и их действия направлены на достижение истины, решения проблемы спора. По существу, это и есть дискуссия, важной характеристикой которой, является аргументированность.