Смотря какую цель преследовал сам психотерапевт. Если с целью подвести пациента к воцервклению или навязать собственные религиозные взгляды - то недопустимо.
Притча все-таки аллегорическая форма изложения. То есть, выводы каждый человек из нее делает свои, опираясь на собственные ассоциации. Никто ж не нервничает, слушая басню, потому что там животные ведут диалоги. А если человек акцентировал повышенное внимание только на этом факте (на животных, обладающих даром речи), то психолог вправе рекомендовать и более узкого специалиста по нервным расстройствам.
Есть религиозные фанатики, есть воинствующие атеисты. Суть этих представителей одна и та же - идея фикс. И если, по градусам эта идея зашкаливает, то вопрос уже стоит о сверхценной идее, со всеми выходящими последствиями.
Если все же, пациент-атеист сфокусировал внимание не на сути притчи, а ее участниках, значит, в наличии некий травмирующий факт и психотерапевт запустил интервенцию, которая активировала невротическую реакцию. Здесь уже лучше попробовать поработать в этом направлении, что бы достать из бессознательного причину такого обостренного реагирования.