Может ли интернет-провайдер видеть сайты, которые вы посещаете через Tor или VPN?

VPN – от английского слова Virtual Private Network, что означает виртуальные приватные сети. По сути в глобальной сети на сегодняшний день создаются каналы связь между двух точек или множество к одной, где весь трафик шифруется различными алгоритмами, при этом метод шифрование и пароль согласуется при инициализации канала для создания ключа шифрование. На протяжение сеанса связь, весь траффик со страны, в том числе и провайдера определяется как VPN туннеле. Содержание этого туннеля остается не известен.

На счет сигнатуры:

Каждая программа, в компьютере которая взаимодействует с сети, имеет свой собственный порт, протокол, заголовке. Вот на этом основание и можно определить какое приложения работает на конкретный устройство, они могут быть множество (whatsup, firefox, outlook, chrome….) и системы могут отличить траффик и его сортировать. Но это не связано с VPN.

Туннель изначально шифруется и все эти приложение работают уже внутри туннеля, и никто не может определить их. Провайдер может только прервать туннель, или блокировать порт, который использоваться для создания туннеля. (но и в таких случаев есть лекарство) :-)

Для определения у вас настроен туннель или нет, достаточно зайти на любой сайт, который показывает ваш внешний IP, если он отличается от тот который вам провайдер выдал, то вы туннель. (можно проверить, до подключения VPN и вовремя подключение). На пример: https://myip.ru/