Кто-то назовет "О природе вещей" Лукреция Кара. Кто-то атеистические работы Гольбаха. Я на первое место поставлю Трипитаку - священное писание буддизма. Вот такая это религия: религия без бога, персонализм без человека и спасение... в ничто!
Ландау, Лифшиц "Курс теоретической физики" в 10 томах.
Фихтенгольц "Основы математического анализа"
Дарвин "О происхождении видов"
Павлов Учение о рефлексах
Библия это ведь собрание разных текстов. Тогда и библия атеиста должна включать несколько достойных авторов. Один из них должен быть Огюст Конт. Другой Макс Мюллер (6 систем индийской философии) Думаю, что еще найдутся.