Давайте для начала разберемся в терминах.
Атеист -- человек, отрицающий бога.
Библия -- священный текст, канон, догмат.
С одной стороны ответ выше, про "никакую" правдив, ни одни книга для атеиста не может считаться священным писанием или догматом.
С другой стороны если понимать слово "Библия" более простонародно: "Вот эта кулинарная книга -- просто библия для повара!", то получается мы лишь ищем качественную книгу, с хорошей и полной подборкой аргументов, отрицающих существование бога (как основу атеизма). Наиболее полной подборкой, я бы даже сказал. Еще можно сказать "настольную книгу атеиста".
Вероятно на ум придёт что-то из Докинза, "Бог как иллюзия", к примеру, он всё ещё в тренде у атеистов, и книги на эту тему писал.
Ландау, Лифшиц "Курс теоретической физики" в 10 томах.
Фихтенгольц "Основы математического анализа"
Дарвин "О происхождении видов"
Павлов Учение о рефлексах
Библия это ведь собрание разных текстов. Тогда и библия атеиста должна включать несколько достойных авторов. Один из них должен быть Огюст Конт. Другой Макс Мюллер (6 систем индийской философии) Думаю, что еще найдутся.