Какую книгу можно назвать библией для атеиста?

Такой книги нет. Атеисты - это носители разных убеждений, а то и ещё более разнообразных, чем у сект традиционных религий. К примеру, Карл Саган был атеистом, но концепция натуралистического бога прослеживается в ряде его высказываний. Для атеиста Эйнштейна была приемлема безличностная концепция Спинозы. Если изучить историю атеизма, то в глубокой древности атеизм не только не отрицал бога, но и подтверждал по-своему. Определённые атеистические убеждения также присутствуют в буддизме. И с другой стороны, в современности, для определённой части атеистов слово "бог" вообще не имеет смысла или объекта, а среди русских атеистов-герметистов попадаются функциональные идеи о том, что Сталин был богом. Субъективен и взгляд на определённые убеждения. Из-за отсутствия единого определения слова "бог" до сих пор нет однозначного ответа является ли человек богом в гуманизме, так как можно утверждать, что светские гуманисты - это "истинные" атеисты? Общее у атеистов только то, что они отрицают конкретного бога, т.е. Бога Авраама или Брахму, но не могут отрицать бога без заданных параметров, а фактически отрицают сами параметры собирательного бога, а не Бога как Такового. Ни в одном священном Писании не сказано, что для веры в Бога нужен научный эксперимент, как правило это даже отрицается как противоположное вере. Бог познаётся через веру и если бы Его возможно было постичь в ходе научного наблюдения, то это скорее бы опровергло как целесообразность самой веры, так и существование Бога, а путь в Рай стал бы очень широким и лёгким. Попытки резюмировать атеистическую мысль предпринял  учёный Ричард Докинз в книге "Бог как иллюзия", но за исключением третьей главы и некоторых отрывков других глав книга оказалась очень слабой сатирической писаниной, наполненной рядом теологических ошибок и несоответствий. Печально было наблюдать, как талантливый учёный лезет не в своё дело и опускается до уровня ворчливого сатирика, начитавшегося английского перевода Библии на досуге, хоть и с общим выводом о недостоверности Библии я согласен, но тут стоит отметить, что многие тексты уже давно критикуются как внутри авраамистов, так и вообще христиан без помощи недалёких умозаключений Докинза, а изучавшим все основные религии мира, философию и науку сама идея написать такую книгу будет заведомо провальной и бесполезной. Воинствующие атеисты рождаются от личной обиды, чьих-то заказов, идеологий прогресса и определённой философии, а умных атеистов чужие верования не интересуют в принципе и писать книги им некому или не о чём.