Да, исчисление "бесконечно малых" (дифференциальное исчисление) не базируется на базовом свойстве этого мира "все можно поделить бесконечно много раз". Но, исчисление бесконечно малых достаточно хорошо согласуется с опытом, те эмпирично.
К пониманию истинности могут быть отдельные вопросы.
С точки зрения математики дифуравнения истинны, те выведены непротиворечиво из аксиоматического базиса. Тут не может быть сомнений.
С точки зрения эмпиризма проблема в существовании и поведении бесконечно малых величин и возможности делить физические величины (расстояние, время, масса, ....) на бесконечно малые доли.
Эксперимент показывает что пока мы не столкнулись с противоречием опыту. Несмотря на то, что идея абстрактно бесконечно малых в реальности не верна, но на нашем макроуровне результаты решения дифура и опыта после округления, доступной нам точностью измерений, совпадают.
Те замена бесконечно малого диференциала на малое приращение хороша тем, что такое усреднение малых диференциалов и колебаний величин на них дает достаточно хорошее (точное) значение.
Это все возможно для "достаточно" гладких и непрерывных функций. И похоже, физические величины (в первую очередь длина и время) этого мира как раз таковые и есть. По крайней мере, мы еще не достигли уровня где эта дискретность проявляется.
Важно, что даже если и есть эта дискретность (пространства) она сохраняет результат расчета в котором предполагается что ее нет. А ведь могло быть не так.