В библии есть эпизод, когда Иисус изгнал всех лавочников и запретил торговать в храме. Почему сейчас торговля в православных храмах процветает?

Иудейский Храм никакого отношения к христианским религиозным сооружениям не имеет.

Иудейский Храм был построен по повелению Самого Б-га и для поклонения Ему единому.

христианство же , это официально с 4 века , греческая религия идолопоклонников, 

Поэтому что бы там христиане у себя не продавали и не устраивали , это их личное дело.

А из Храма иисус никого изгнать не мог, по причине , что в Храме никогда никакой торговли не было.