Потому же, почему сейчас так враждебно настроены друг против друга Россия и Украина: из-за близкого родства и общей истории, которые теперь делят и поделить не могут. Подгадили и англичане, намеренно разделив единое прежде государство на два так, чтобы остались территориальные проблемы и нерешенные вопросы. Плюс к тому, Пакистан - мусульманская страна, (преимущественно), а Индия - многоконфессиональное государство.