Для научного образа мышления недостатков нет, если приверженность этому мышлению применяет стандарты и принципы научного поиска истины (проверяемость, обоснованность, достоверность и т.д.). Для своих целей методы науки вполне пригодны, тем более они постоянно совершенствуются через обратную связь (теория - факты, если это дедуктивный способ исследований, и факты - теория, если индуктивный). Слабым местом, если это так можно назвать, для научного образа мышления могут быть только вопросы этики: насколько допустимы те или иные эксперименты (опыты на людях) и применение научных результатов в обществе (генная инженерия, например). Но этими вопросами занимается биоэтика, есть гуманитарные экспертизы, различные комиссии и рамочные документы по этическим пределам использования в научных целях объектов живой природы.