Вариант 1: Прибыли бы новые завоеватели, и колонизация просто была бы отложена на несколько десятилетий (уже есть в другом ответе).
Вариант 2: Если бы повторная волна не последовала, то:
а) Сейчас в Новом Свете были бы не современные, а чисто индейские государства. (Кстати, в одном фантастически-фентезийном произведении была Ацтекская империя в Мексике, хотя время действия - кон. 19-го века).
б) Индейские государства просто получили бы отсрочку до сер. 19 века, (так как тогда военные технологии сделали резкий скачок вперед, да и колониализм приобрел особый размах), а после разделили судьбу зулусов.
Ну, а ответное вторжение в Европу лично мне кажется маловероятным. Для индейцев дальнее мореходство никогда не было характерной чертой (даже эскимосы выходили в море для охоты, а не ради путешествий и колониализма), европейцы же бороздили моря еще со времен Античности.