Почему одни, чем глубже вникают в религию, тем больше верят, а другие, чем больше вникают, тем больше становятся атеистами?

На  этот вопрос Христос дал ответ в притче про сеятеля - семя попадая в разные почвы дает разный результат. Почва  это сердце человека, его сокровенная суть.

Нужно добавить, что речь идет не вообще о религии, потому как религии бывают очень разные, да и версий христианства очень много. Но в притче речь идет именно о Словах Христа, которые Он называл Словом Божьим, то есть об Истине. Так вот, Истина соприкасаясь с человеческим сердцем дает разный результат. Итак, сама притча;

3 И поучал их много притчами, говоря: вот, вышел сеятель сеять;

4 и когда он сеял, иное упало при дороге, и налетели птицы и поклевали то;

5 иное упало на места каменистые, где немного было земли, и скоро взошло, потому что земля была неглубока.

6 Когда же взошло солнце, увяло, и, как не имело корня, засохло;

7 иное упало в терние, и выросло терние и заглушило его;

8 иное упало на добрую землю и принесло плод: одно во сто крат, а другое в шестьдесят, иное же в тридцать.

9 Кто имеет уши слышать, да слышит!

(Матф.13:3-9)