Есть три основных минуса: цена, незащищённость и ограниченное кол-во циклов перезаписи.
Цены на SSD падают, но всё ещё стабильно высокие по отношению к жёстким дискам.
Если SSD накроется, восстановить информацию будет невозможно.
Также у SSD есть предел циклов перезаписи, после превышения которого он либо полетит, либо впадёт в режим чтения.