Ленин писал, что "единство... угнетённого класса за создание рая на земле, важнее для нас, чем единство мнений пролетариев о рае на небе". И, изначально, большевики не планировали никаких репрессий против церкви. Однако, как вспоминал Сидор Артемьевич Ковпак, служивший в гражданскую в Красной Армии в трофейной команде, у него лично "неприязнь" к церкви наступила после того, как в алтаре одной из церквей было обнаружено оружие. На вопрос, для молений во имя какой Богоматери батюшке понадобился пулемёт "льюис", батюшка ответить не смог.
И как всегда в случае с большевиками, декларация осталась на бумаге, а на деле.... )))
Коммунистическая идеология сама по себе является псевдорелигией очень близкой к христианству. Поэтому православие воспринималось коммунистами как конкурирующая идеология, а конкурентов надо уничтожать. Вот с церковью и разобрались.