Коммунистическая идеология сама по себе является псевдорелигией очень близкой к христианству. Поэтому православие воспринималось коммунистами как конкурирующая идеология, а конкурентов надо уничтожать. Вот с церковью и разобрались.
И как всегда в случае с большевиками, декларация осталась на бумаге, а на деле.... )))