Нет.
Если ванны абсолютно одинаковые - у них одинаковое сечение сливного отверстия. Значит, и вода будет уходить одинаковым темпом.
Ответ: они опустеют с одинаковой скоростью.
Высота никак не влияет (если давление воздуха в сливной трубе равно атмосферному, в противном случае это уже совсем другая история).