Можете, но если это первая поездка по визе, то вы должны провести больше дней в Чехии, чем в другом государстве ес. Если это вторая и более поездка по уже открытой визе, то это уже не важно.
Да и при получении визы, вы же должны предъявить не только билеты но и бронь в отеле подтверждающую ваши намерения пробыть в этом государстве больше времени. Кстати чисто гипотетически, если вы пробудите большую часть времени в Нидерландах. То при выдаче следующей визы в страны ЕС вам могут и отказать, или ограничить время прибывания.
А если количество дней совпадает?