Если вопрос встал в период острой необходимости капать в глаза, то никак. Самый предпочтительный, как написали выше, фиксация. Как вариант, можно попробовать одному непрерывно давать собаке лакомства, тем самым отвлекая её (легче всего в таких случаях использовать конг, можно какой-то мусс или паштет в тюбике, в общем то, что собака будет вылизывать долгое время), другому в момент дачи лакомства закапать в глаза, но скорее всего некая фиксация все равно потребуется.
Если вопрос стоит в обучении собаки закапыванию, надо начинать постепенно к приучению к тому, что это не страшно (смена эмоций и десенбилизация) достал тюбик с каплями - вкусняшку, зафиксировал морду на секунду - вкусняшкку, завел руку над глазом-вкусняшку, сделал холостой пшик в глаз - вкусняшку, постепенно собака свяжет эту процедуру с положительными эмоциями и не будет вырываться.