Шифрование осуществляется сертифицированными ФСБ криптосредствами по российскому ГОСТу. Естественно, на принимающей стороне должна быть установлена такая же программа.
Есть сервис безопасной веб-почты, основной фичей, которого является возможность шифрования письма ещё до того, как оно отправится на сервер. Сервис называется ProtonMail protonmail.com
Простой способ, который поддерживается почти всеми почтовыми програмами - wikipedia.org Там вам и авторизация и криптография. Но за сертификатами конечно надо следить