Я, конечно, не эксперт, но, вероятно, дело во многом заключается в стремлении Навального к публичности. На одном его канале на ютубе примерно 770 тыс. подписчиков, что, согласитесь, немало. И если вдруг его убивают, как, к примеру, Немцова, то поднимется нехилая такая шумиха, и эти тысячи недовольных людей будут искать справедливость. Не найдут в России - будут давать интервью западным СМИ, идти в тот же самый Европейский Суд и искать виноватых.
Существует еще мнение, что Кремлём Навальный воспринимается как мелкая сошка, не обладающая реальной политической силой (в подобном ключе о нём всегда и высказываются). И эта точка зрения также небезосновательна. В таком случае нет смысла марать об него руки, если он ни на что не способен, кроме "популистских" выходок.
В общем, можно считать как угодно, но сам факт того, что мы с вами сидим и рассуждаем о том, почему человек, несогласный с существующим правительством, до сих пор жив и здоров, заставляет сделать некоторые выводы о режиме в нашей стране.