Авто-проектирование удобно для типовых задач. И выдают типовые решения.
Так же эти системы стоят достаточно дорого и не все их могут позволить, особенно для мелких дешевых заказов.
Наложить сверху требования по квалификации... и такие системы становятся ОЧЕНЬ дорогими.