В целом частиц, "загрязняющих" воздух, природного происхождения больше, чем антропогенного. Но в густонаселённых районах и крупных городах техногенное загрязнение очевидно доминирует.
Но чтобы разобраться о чём речь (про указанный в вопросе рейтинг) стоит посмотреть более авторитетные и подробные источники, чем Комерсантъ:
Аэрозольные загрязнения антропогенного происхождения (созданные человеком) составляют ~10% от всех аэрозольных загрязнений на планете. Но это с учётом солевого тумана над океаном, а он, судя по самым чистым странам (Австралия, Исландия, Финляндия, Норвегия и др.) в измерениях рейтинга AQI не участвует (вероятно, эти частицы больше, чем PM2,5).
И, конечно, роза ветров и близость каких-либо источников аэрозольных частиц, в т.ч. природного происхождения будет влиять на этот показатель в конкретном месте или городе.
Про Красноярск немного удивило. Но это они в Норильске загрязнение не измеряют...