В первую очередь нужно учесть, что слово "ном" как таковое ни к Древней Месопотамии, ни к Древнему Египту не имеет никакого отношения, хотя бы потому, что это термин древнегреческий, а не древнемесопотамский или древнеегипетский (я специально не заостряю внимания на том, какие там были языки. Что до эпохи эллинизма не древнегреческий, это 100%). Поэтому слово "ном" не просто описывает чуждую этим древним странам реальность, но оно к тому же описывает ее на чуждом нам (как русским) языке.
Так что, на мой взгляд, лучше всего перефразировать Ваш вопрос так: "Почему в Древней Месопотамии общины местных жителей переросли в самоуправляемые города-государства, а в Египте - в царства, ставшие основой типичной восточной деспотии?"
Замечу, что слово "деспотия" тоже древнегреческое, к тому же имеющее ярко выраженную отрицательную коннотацию. А в словосочетании "восточная деспотия" - по сегодняшним временам, еще и расистский оттенок. Но, поскольку иного термина в науке просто не придумали, оставим так.
Так вот, любой, кто интересовался историей древнего Востока, сразу заметит в Вашем вопросе грубую ошибку (назовем это так). Дело в том, что на "городах-государствах" в Междуречье государственное строительство не остановилось! За ними пошли царства различного размера, за ними - империи, древнейшая из которых - империя Хаммурапи, а позднейшая - вавилонское царство Навуходоносора (их разделяет примерно 800 лет). Я так думаю, что Вы отождествляете месопотамские города-государства с древнегреческими полисами. Но ведь это две совершенно разные вещи! Полис - это союз свободных граждан, живущих на определенной земле и этой землей сообща (формы могут быть разными, я тут не буду подробно останавливаться) владеющих. Отсюда, кстати, пошла и демократия.
А вот месопотамский город-государство - это военно-административный центр, владеющий сельской округой того или иного размера. То есть фактически - мини-деспотия, по сути не особо от всех других восточных деспотий и отличающаяся. Конечно, при желании отличия можно найти, но то, что Месопотамия все время рождала именно царства разной степени бюрократизированности, а, скажем, не что-то наподобие Римской республики, достаточно красноречиво говорит о сути месопотамских мини-государств.