Работодатель вряд ли добровольно будет выплачивать компенсацию. Тем более ошибку допустил какой-нибудь бухгалтер. Значит, компенсацию надо будет требовать через суд конкретно с этого бухгалтера. Но при этом надо будет доказать в суде, что эта ошибка нанесла ущерб и требует компенсации. А это не всегда возможно.
Да, конечно, если сможете доказать, а компенсация только за пользование чужими денежными средствами по ставке рефинансирования. Но лучше с работодателем мирно договориться