Какое-то странное обобщение. Люди все разные, независимо от их воззрений, веры, атеизма.
На мой взгляд, любой человек с характером будет отстаивать не, чтобы свои взгляды, а будет противиться насилию в любой форме. Дело тут не во взгляде, а в характере: одни люди более покорны, другие - более свободолюбивы
Но, как Вы себе представляете "гонения на атеистов"? Если будут со стороны христиан? Насильное крещение? Так любой атеист может пройти эту процедуру, как просто традицию (как многие атеисты, или, прикидывающиеся христианами, и делают на самом деле). Ведь, для атеиста крещение вообще не значит абсолютно ничего, просто как "дань традиции". После процедуры крещения атеист не будет считать себя обязанным соблюдать христианские традиции, и следовать канонам.
Если к атеисту будет применяться религиозное насилие, то он будет сопротивляться (те, кто не боится, и умеет сопротивляться), но не как "за свои убеждения", а просто как сопротивление насилию над ним.