В целом нет, если конечно у человека здоровая психика и в достаточной мере развита критичность. Ко всему прочему, атеист в большей степени склонен изучать именно научно подтверждённые факты. А уфология, конспирология и т.п. идеи завязаны в основе своей на идее существования нечто сверхъестественного. Лично я сколько вижу и читаю людей, которые поддерживают псевдонаучные идеи, это всегда люди верящие в что-то сверхъестественное, а соответственно таких людей нельзя считать атеистами.