Видите ли вы парадокс в установке сверху на Кью быть против эзотерики и лженаук, но не против верующих?

Ничего не знаю о таких установках. 

Допустим, это правда. Тогда в вашей формулировке не вижу противоречий. Бороться надо не с людьми (верующими), а с их тезисами (лженаука, эзотерика, религиозные предрассудки).

И ещё. Религия — это довольно значимый культурный пласт. Не вижу ничего плохого в том, чтобы говорить о ней без явной апологетики — просто донося содержание священных текстов, или анализируя с позиции социологии, религиоведения и других наук.

В общем-то, что-то такое можно сказать и про эзотерику с лженауками. Но у них культурная значимость несколько по-меньше. Да и лженауки, как очевидно вредное явление, стоит обсуждать с оговорками о том, что это именно лженаука.