Ну вообще-то даже из школьного учебника можно вычитать, что атом состоит из электронов и ядра, состоящего, в свою очередь, из протонов и нейтронов, которые также состоят из кварков… При этом, нейтроны, например, не имеют заряда. Так что, атом уже имеет в своем составе материальные частицы без заряда.
Однако, сама постановка вопроса кажется несколько странной. Во-первых, атом состоит не из зарядов, а из элементарных частиц, которые являются вполне себе материальными. Даже фотоны света материальны, что уж говорить о частицах, обладающих массой покоя. Во-вторых, заряд - это только лишь одно из свойств этих частиц, но наличие заряда уже говорит о том, что это нечто материальное: нематериальные объекты не могут обладать электрическим зарядом, т.к. электрическая энергия - один из видов материи. Поэтому противопоставление зарядов и материальных объектов в вопросе выглядит странно.