Для подавляющего числа атеистов, атеизм это определённая философская позиция, но ни как метод познания мира. Есть разделение на стихийный и научный атеизм, и вот сдесь уже есть варианты.
Стихийный атеизм — атеизм, понимает под собой, как правило просто здравый смыс и отсутствие веры в сверхестественное.
Научный атеизм — это атеизм, основанный на естествознании, вот и подразумевает под собой научный метод.
Большинство современных атеистов относятся больше к первой категории, так в большинстве своё религия в современном обществе занимает не такое большое место как несколько веков назад. В ту эпоху если человек себя и признавал открыто атеистом, то делал это больше исходя из научного познания мира.