Дальше налоговая снимет его с учета, как самозанятого. После чего можно оформить ИП и продолжить работу с клиентами как раньше. Либо можно заключить договора ГПХ с клиентом-юрлицом. Ну либо закрыть официально бизнес до конца года )
Договор ГПХ , правда, вряд ли кто будет заключать при таком раскладе, так как в этом случае юрлицо становится обязано само начислять и уплачивать НДФЛ и страховые взносы за физ.лицо, работающее по договору. А оно им надо, вот честно?
Так что по сути остается только стать ИП. Тут тоже есть подводный камень. Автоматом ИП получает общую систему налогообложения, то есть надо будет считать НДС. Это не самый простой процесс. Поэтому в течение 20 дней после утраты статуса самозанятого лучше будет подать в налоговую заявление на переход на УСН или патент (если возможно). Да, придется платить более высокие налоги и обязательные страховые взносы, зато сможете продолжить работу без проблем с клиентами.
Успехов )