Да, можно.
Вычет на лекарства и на покупку жилья - это 2 самостоятельных вида вычета. Их можно получить одновременно.
Оба вычета нужно указать в одной декларации по доходу физических лиц (форма 3-НДФЛ). Ваш доход, облагаемый налогом, нужно сперва уменьшить на вычет по лекарствам, а ту сумму дохода, которая останется на вычет по покупке жилья. Декларацию составляют за тот год за который вы получаете вычеты. К ней прикладывают копии документов, которые подтверждают ваше право на первый и второй вычет.
Подробнее о том, как оформить эти вычеты смотрите по ссылкам:
К декларации прилагают и заявление на возврат налога.