Регистрационный учёт не устанавливает право собственности. В данной ситуации, т.к. новый владелец не регистрировал автомобиль, а вы просто сняли его с учёта, для налоговой службы вы по-прежнему являетесь его владельцем и вам регулярно будет начисляться транспортный налог. Помимо снятия с учёта, вам нужно обратиться в налоговую, предоставив договор купли-продажи, что бы с вас "сняли" данный автомобиль.