Для начала нужно оговорить, что популярен не яой, а сёнэн-ай. Уж поверьте, например бара-яой не славится популярностью у девушек практически вообще.
Сёнэн-ай даёт красивую картинку (стиль весьма стандартизирован можно сказать, ориентирован на женскую аудиторию), выстраивает сюжет вокруг романтики, роман построен вокруг весьма робкого отношения между мужчинами, добавляет красок ещё и факт запретности любви в каком то смысле.
Романтика стереотипно нравится девушкам, а так как сёнэн-ай это всегда романтика, конечно он заходит девушкам. Образы, которые чаще всего представлены в сёнэн-ай это красивые мужчины, галантные или просто до приторности милые — логично, что для девушек, особенно молодых, это интересно.
Нууу... Я бы не была столь категорична насчёт бара-яоя.