Теплоноситель из контура отопления может попасть в контур ГВС? Мы хотим в систему залить антифриз, не хочется чтобы он смешивался с водой.

Да, вполне может. Точнее при штатной работе верно сконструированной системы отопления этого произойти не может никак. Эти два контура разделены теплообменниками, на подпитке стоит обратный клапан. НО!!! При нештатной ситуации, (поломке) это может легко произойти. Причем самое печальное, что вы этого врятли сразу заметите.
Дело в том, что существуют возможность и она вполне вероятно, к примеру у себя в инстаграмме я это показывал, https://www.instagram.com/p/B82Ii_GqqP1/?igshid=16uugqqc8f9ti что "пробивает" теплообменник бойлера и эти два контура становятся взаимосвязанными. И подобные обращения не редки.
Ещё чаще случаи пробоя теплообменника на двухконтурных котла, в силу меньшей толщины стенки, условий их работы и собственно конструкции. Так же может подтравливать и обратный клапан на узле подпитки.
Надеяться на то, что давление в системе гвс выше чем в отоплении, не стоит. Ибо оно там выше не всегда. Как только вы открываете кран горячей воды. Особенно при загрязненном магистральных фильтре, давление в бойлере достаточно сильно падает.
Поэтому при явной необходимости использования антифриза есть только один метод гарантированно исключить подобную проблему. Использовать отдельный бойлер прямого нагрева. Газовый, либо электрический. И всегда держать кран автоподпитки закрытым