Теплоноситель из контура отопления может попасть в контур ГВС? Мы хотим в систему залить антифриз, не хочется чтобы он смешивался с водой.

Зависит от оборудования. Если контуры не пересекаются ни в теплообменниках, ни в клапанах, то никак не попадёт. Но нужно учитывать, что не все котлы (и другое оборудование) могут работать с антифризом, смотрите паспорт котла.

У нас на даче был двухконтурный настенный газовый котёл и при поломке в нём трёхходового клапана вода из контура ГВС попадала в отопление. Батареи летом грелись при открытии крана горячей воды на смесителе раковины или душа. Предполагаю, что если клапан будет подвисать в другом положении, соответственно возможно и обратное попадание.