Сугубо субъективный и краткий список.
Классика гениального мастера кинематографа - Акиры Куросавы: Жить (1952) , Семь Самураев (1954), Телохранитель (1961) ,Сны (1990) , Расёмон (1950) , Еще нет (1993), Трон в крови (1957).
Фильмы несравненного Ясудзиро Одзу, в которых, как мне кажется, дух японской культуры и менталитета – максимален в каждой сцене: Поздняя весна (1949), Токийская повесть (1953), Ранняя весна (1955), Раннее лето (1951), Вкус сайры (1962).
Другая классика: Хиросима, моя любовь (1959), Голый остров (1960), Полевые огни (1959), Женщина в песках (1963), Химико (1974).
Японские хорроры – наполненные уникальной эстетикой и жуткой атмосферой: Женщина-Демон (1964), Кайдан (1964), Черные кошки в бамбуковых зарослях (1968), Под сенью цветущих вишен (1975), Слепое чудовище (1969), Тэцуо (1989), Девочка-змея и ведьма с серебряными волосами (1968), Проклятие (2000), Любовь к резине (1996), Гипнотизер (1999).
Образцовые и талантливые самурайские фильмы: Меч судьбы (1965), Госпожа Кровавый Снег (1973), Харакири (1962), Тень повелителя (1989), Ниндзя сегуна (1980), Война кланов (1963), а также эффектная серия фильмов Меч отмщения (1972-1974), .
Достойные работы современного кинематографа: Признания (2010), Ушедшие (2008) Снято! (2011), Двухкомнатная квартира (2003), Урок зла (2012), Котоко (2011).
Буду банален - "Расёмон" Акиры Куросавы. Альфа и омега японского кинематографа. Ещё, вопреки формулировке вопроса, рискну посоветовать французский фильм Алана Рене "Хиросима, любовь моя".
Действительно самый трогающий душу режиссер.
"Империя чувств" (реж. Нагиса Осима). "50 оттенков серого" для людей старше 18 лет, которые видели и читали что-то кроме "50 оттенков серого".