Конечно. Причем для этого есть целых 2 способа:
первый - отправляете жалобу в вышестоящий налоговый орган (это налоговое Управление вашего региона);
второй - обращаетесь с исковым заявлением в суд (общей юрисдикции или арбитраж).
Причем воспользоваться вторым способом вы можете только при условии, что уже использовали первый, но не получили нужного результата.