Проблема не в том, что Вы говорите с верующим, а в том, что пытаетесь доказать свою точку зрения (об этом сказано в вопросе). Тоже самое будет и в споре с фанатом другой футбольной команды или приверженцем другой политической партии. Также проблема может быть и со стороны Ваших оппонентов, для которых, вероятно, религия - основная тема для разговоров. Тоже самое опять же бывает и с парнями из качалки, и с любителями аниме - с ними бывает просто не о чем поговорить кроме их сферы деятельности. У меня много друзей атеистов, мы нормально общаемся. Секрет в том, чтобы не говорить на те темы, которые могут вызвать разногласия или говорить только в той мере, в которой это не обидит человека, не заставит его доказывать обратное.
Наверное, по той же причине, по которой сложно поддреживать разговор с атеистами, которые узнали, что вы верующий. Особенно, если начинать навязчиво приводить им всякие доказательства.
Ну вот, сами же и обобщили.