Скорости на каждом отдельном участке железной дороги строго регламентированы и зависят от огромного количества факторов. Для начала стоит сказать, что скорости движения поездов по перегонам и станциям устанавливаются начальником железной дороги и предусматриваются в графике движения поездов. Не буду загружать ответ большим количеством правил, влияющих на скорость движения поезда в том или ином случае. Скажу лишь, что она зависит например от марок крестовины, категории поезда, особенности перевозимого груза и его габаритности, количества путей на перегоне, сигналов светофоров, работы обслуживающих машин на участке и еще великое множество различных факторов.
Причин этому может быть очень много. Например:
1) проезд желтого сигнала светофора
2) несовершенство графика движения
3) движение по стрелкам