Если поезд идёт через станцию не по главному пути, он должен снижать скорость при прохождении стрелок чтобы не повредить их. Особенно хорошо это заметно когда поезд отходит от крупного вокзала. Через стрелки, собирающие выезды со всех платформ на главный путь, поезд (даже скорый) крадётся медленно-медленно.
Причин этому может быть очень много. Например:
1) проезд желтого сигнала светофора
2) несовершенство графика движения
3) движение по стрелкам