Если говорить кратко: с самого начала между Северусом и Джеймсом возникла неприязнь. Северус выглядел странным (так как был чрезвычайно увлечён тёмными искусствами и выглядел очень неопрятно).
Когда Гарри спрашивает Сириуса почему Джеймс так себя вёл он отвечает, что они были юными и глупыми, Джеймс позже перестал издеваться над Северусом, так как повзрослел.
прошу простить, что не дословно.
Потому-что отец Гарри Поттера имел темную сторону, равно как Снейп имел светлую сторону.
Это было показано в незначительном фрагменте, меняющем представление о двух персонажах.