Сергей, добрый день! Поскольку я не являюсь контрагентом Яндекс. Такси, и никто из моих клиентов тоже, суть вашего вопроса мне непонятна. О какой комиссии идёт речь? О каком налоге идёт речь?
Предположу, что речь о комиссии за осуществление переводов денежных средств/ осуществление расчётов, а налог - НДС.
Если так, то Я. Т. это компания, применяющая общую систему налогообложения (ОСНО) . При ОСНО все виды реализации фирмы, в том числе комиссии по сделкам, облагаются НДС.
Бухгалтерское обслуживание от 1500 руб.
Помощь и защита при налоговой проверке. 
Перейти на taxprofi.ru/contacts
Вы внимательно прочитайте вопрос.
Если вы рассматриваете себя, как самозанятого, то в ваших отношениях с клиентом могут быть только две стороны – клиент и лично вы. Юридически, вы получаете 5000 рублей с клиента, платите с них налог на профессиональный доход, и... Читать далее
Я с вами не согласна, водитель должен платить налог как самозанятый со своего общего дохода, но не плюсом дохода Яндекс такси😱
Первый
Доходом водителя, считается та сумма, которую пассажир заплатил за поездку. Следовательно в налоговой базе должна указываться полная сумма, а не та которую яндекс перечислил уже за вычетом комиссии.
То, что на счет водителя... Читать далее
Первый
Яндекс берет не чисто комиссию с суммы которую оплатил пассажир а включает туда НДС с этой суммы. После суммирует этот НДС и комиссию и вычитает это из дохода таксиста. И водитель такси являясь самозанятым, опять же платит с... Читать далее
Потому, что клиент заплатил за поездку, а потом водитель рассчитался с Яндексом за поиск клиента.. в этом случае сначало доход, а потом расход. Они продают Вам клиента, а после получения прибыли с выполненного заказа Вы с... Читать далее
С вами согласна лишь в том, что у водителя свои расхода бензин, страховка ,путевки , ремонт авто ит.д., которые... Читать дальше