Отмечу, что путепроводом часто называют не над, а под. Автомобильный проезд под железной дорогой в Москве называется путепроводом. (Не знаю, насколько это архитектурно-строгое название.)
Путепровод - это дорога над дорогой, если по-простому, чтоб друг другу не мешали.
Мост - это дорога через какое-либо препятствие (река например).