Дело в том, что система изначально настроена на стабильную работу, но, со временем добавляет различные модули, в том числе и в само ядро. То есть - чем больше она используется, тем больше вспомогательных элементов появляются непосредственно внутри системных папок для обработки которых постоянно задействуются ресурсы пк.