Когда вы прикасаетесь к больному месту рукой или его растираете, организм в этот процесс вовлекает большое количество нейронов.При прикосновении к кожи сенсорные нейроны, воспринимающие прикосновение, "гасят" болевые нейроны.Все это облегчает боль.Кроме того это чисто инстинктивная реакция.Человек как-бы защищает больное место.Здесь уже давали ответ на подобный вопрос.
Предположу, что это отвлекающий маневр. Внимание смещается с больного места на давление руки. Кроме того, надо как-то пристроить напряжение в мышцах, которое нередко боль сопровождает.