Да.
За пищеварение отвечает парасимпатический отдел вегетативной нервной системы, конкретно - блуждающий нерв, nervus vagus. Говорят, что "ночь - царство Вагуса". Именно ночью парасимпатика дает о себе знать лучше всего: так, например, под утро чаще случаются приступы у астматиков и сердечников. Но наедаться на ночь все равно не следует - иначе будете плохо спать.