А почему бы и нет ? Главное, правильно отделить "головы" и "хвосты". Единственно то, что придётся снова ждать нагрева куба, если прервать процесс до его остывания.
Повторная перегонка самогона нужна для того, чтобы улучшить сам вкус самогона. Советуют не останавливать перегонку. Но если нужна такая необходимость можно остановить на полчаса максимум. И потом продолжать дальше.